Пономарев Алексей Алексеевич родился 22 марта 1942 года в большой крестьянской семье (девять человек детей), в поселке Ильинка Таловского района  Воронежской области. В 1949 году пошел в 1-ый класс,  а в 1959 году окончил среднюю школу.

В 1959 году поступил в Воронежский сельскохозяйственный институт, который закончил в 1964 году по специальности ветеринарный врач. С 1964 года по 1965 год служил в рядах Советской Армии в Германской Демократической республике. С 1966 года (январь) начал трудовую деятельность в должности главного ветеринарного врача совхоза «Восход» Никифоровского района Тамбовской области. В мае 1969 года был назначен директором совхоза «Восход» Никифоровского района Тамбовской области, а в феврале 1973 года генеральным директором районного специализированного объединения этого же района.

С 1-го января 1974 года был назначен начальником управления сельского  хозяйства Никифоровского района Тамбовской области, а с октября 1975 года генеральным директором агропромышленного объединения Никифоровского района. С 23-го декабря 1976 года был назначен 1-ым заместителем Начальника  объединения «Тамбовживпром» Тамбовской области, а с июля 1978 года Начальником объединения «Тамбовсвинопром».  После ликвидации в стране промов с марта 1983 – по 1985 года работал начальником отдела свиноводства областного управления сельского хозяйства Тамбовской области.

В 1985 году был избран 1-ым секретарем Петровского райкома партии Тамбовской области.

В январе 1988 года был переведен на работу 1-ым заместителем Председателя агропромышленного комитета Тамбовской области, а в декабре 1988 года заведующим сельскохозяйственным отделом областного комитета партии.

Заочно (с 1987-1990 годы) окончил Высшую партийную школу.

В марте 1990 года на альтернативной основе (5 кандидатов) был избран народным депутатом РСФСР, а в мае этого же года  на 1-ом съезде народных депутатов РСФСР был избран членом Верховного Совета РСФСР, где проработал до октября 1993 года. После расстрела Верховного Совета РСФСР были объявлены выборы  депутатов Государственной Думы, которые состоялись 12 декабря 1993 года, и я был  избран депутатом Государственной Думы по одномандатному Мичуринскому  округу Тамбовской области.

По этому же округу я избирался депутатом в Государственную Думу ФС РФ в 1995 и  в 1999 годах. В общей сложности депутатом Госдумы был в течении десяти лет.

С июня 2005 года по настоящее время  работаю Управляющим делами ЦК КПРФ.  

Членом КПСС был принят в октябре 1968 года, и членство не прерывал,  даже когда партия была под запретом.

После 2-го Учредительно-восстановленного съезда КПРФ, который состоялся в феврале 1992 года я  все время избираюсь членом ЦК КПРФ.

Женат, имею двоих взрослых детей.

Жена – Пономарева Екатерина Михайловна – учительница.

Сын – Пономарев Игорь Алексеевич – военный полковник Российской Армии.

Дочь – Пономарева Людмила Алексеевна – окончила Университет «Дружбы Народов» им. Патриса Лулумбы – иностранные языки.