Фактически его пытаются привлечь к ответственности за высказывание мнения, не совпадающего с тем, которого придерживаются власти. Альгирдас Палецкис позволил себе публично усомниться в официальной версии событий 13 января 1991 года, когда у вильнюсской телебашни погибли 13 человек. Нынешние руководители страны утверждают, что эти люди пали от рук военнослужащих Советской армии. По словам же их оппонента, тогда «свои стреляли в своих». В пользу такого утверждения есть немало серьезных доводов, однако правящие круги всячески замалчивают не вписывающиеся в националистическую идеологию факты.

В июле обком КПРФ провел у здания Генерального консульства Литовской Республики в Калининграде пикет солидарности под лозунгом «Руки прочь от Альгирдаса Палецкиса!».